Windows Terminalが一度に二個起動する現象の対処法

このissueが参考になった

settings.jsonを開いてfirstWindowPreferenceをpersistedWindowLayoutにして保存

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{
    "firstWindowPreference": "persistedWindowLayout",
}

そしたらfirstWindowPreferenceをdefaultProfileに変更して保存

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{
    "firstWindowPreference": "defaultProfile",
}

これで解決した